南麂岛海洋自然保护区位于温州以东近海海域，是我国建立的第一个海岛海域生态系自然保护区。由23个海岛、14个暗礁、55个明礁组成，总面积20106公顷，海域面积19071公顷。区内贝藻类丰富，是中国海域的重要贝藻类基因库。有海洋贝类403种，约占我国贝类总数的20％；海洋藻类174种，约占我国藻类总数的20％。